很多人认为乳房上会有细菌，因此在喂奶前把乳房擦得非常干净；还有人认为刚开始的乳汁比较脏，所以要挤出几滴乳汁以后再哺乳……而这些妈妈极力追求的“无菌环境”恰恰不利于宝宝的免疫系统。
专家指出，目前的婴儿有两类免疫系统疾病很常见：过敏性疾病和肥胖，它们都与肠道菌群不健康或发育异常有关。很多妈妈害怕细菌接触到宝宝，其实细菌需要与人共存，母乳喂养就是先给宝宝喂细菌再喂乳汁，宝宝一出生并非需要保持在无菌环境中生存，无菌反而会给宝宝带来麻烦。
适当的清洁是必要的，但新妈妈要认识到：母乳是非常干净的营养液体，但干净不代表没有细菌，母乳喂养不是无菌喂养过程，而是有菌喂养过程。建议直接喂养母乳，不需要过度消毒，更不需要加温。不提倡在喂奶前先将乳头擦洗得过于干净，因为孩子在吮吸时，可以适当吃到妈妈乳头及乳头周围皮肤上和乳管内的细菌，有利于婴儿肠道健康。
还要注意的是，配方奶的喂养就属于无菌操作，因为奶瓶和奶嘴使用之前都会高温消毒，而喂养方式中也不会引入细菌，因此虽然配方奶企业都会在奶粉中加入活性菌成分，但也远远达不到与母乳喂养相同的水平。