过敏又叫变态反应，牛奶过敏以胃肠道多见。据统计，健康儿童发生率在0.3%-7%，在过敏体质的孩子中可达3%。这是因为孩子胃肠道发育尚未成熟，粘膜通透性较强，牛奶中较大的蛋白颗粒可以渗入粘膜，作为抗原刺激机体产生抗体，抗原抗体相互作用而引起过敏反应。
典型的患儿在吃牛奶过程中，或吃牛奶以后容易发生肠绞痛症状，表现为大声哭闹，颜面苍白，双手握拳，两腿屈曲于腹部，腹胀，排出泡沫样、粘液样稀便或血性便，有时可见皮疹或肛门周围糜烂现象。如果时间持续较久，可出现贫血和脱水，甚至营养不良。停喂牛奶后症状消失，加牛奶后又出现，是本病的主要特征。